Die Trägerschaft der Pestalozzi-Schule ist der gemeinnützige Verein „Schulverein Pestalozzi“ mit Sitz in Sulgen. Der Vorstand des Schulvereins arbeitet auf ehrenamtlicher Basis und besteht aus folgenden Mitgliedern: 

Der Regierungsrat des Kantons Thurgau hat am 6. März 2007 der Pestalozzi-Schule die definitive Betriebsbewilligung erteilt. Zudem unterstehen wir der Aufsicht des Amtes für Volksschule des Kantons Thurgau.

Der Schulverein Pestalozzi wird unterstützt durch die gemeinnützige Stiftung Sokrates mit Sitz in Güttingen.